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[Himalaya-users] eifel-Knoten
by Bram Metsch 13 Dec '10

13 Dec '10

Liebe himalaya-User, Die Klimaanlage wurde repariert und die eifel-Knoten ("-q" und "-qm", erreichbar ueber die quad"-Queue) sind wieder verfuegbar. Viele Gruesse, Bram.

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[Himalaya-users] Update himalaya
by Bram Metsch 07 Dec '10

07 Dec '10

Liebe himalaya-Nutzer, himalaya laeuft jetzt wie die Workstations unter Ubuntu 10.04 LTS. Zunaechst: Jeder muss seinen Code neu uebersetzen. Die wichtigste Neuerung besteht darin, dass wir jetzt OpenMPI statt MPICH als Standard verwenden. Fuer diejenigen, die qsub.binary zum Submitten von Jobs verwenden, aendert sich nichts. Alle anderen muessen den mpirun-Aufruf in ihren Skripten aendern: /usr/bin/mpirun -mca btl mx,sm,self -x GOTO_NUM_THREADS=1 -x MX_RCACHE=0 <Executable> <Optionen fuer Euer Programm> Wie ihr sieht, muss kein -machinefile und kein -np mehr spezifiziert werden. Stattdessen bedeutet: -mca btl mx,sm,self: Benutze Myrinet als Hochgeschwindigkeitsnetzwerk. Ohne diese Option geht die Kommunikation ueber das langsame Ethernet! -x GOTO_NUM_THREADS=1: Um die Anzahl der Threads fuer die GotoBLAS auf eine pro prozess zu begrenzen. Wer die GotoBLAS nicht nutzt, braucht diesen Parameter nicht -x MX_RCACHE=0 : Schaltet den Registration Cache des Myrinets aus. Dieser Parameter sollte immer angegeben werden, wenn Eure Anwendung ein nicht-Standard malloc verwendet (z.B. PETSc). Auf der /opt-Platte sind BlockSolve, Petsc und GotoBLAS bereits an das neue Ubuntu angepasst. Der Rest der /opt-Platte folgt in den naechsten Tagen. Die AMG-Nutzer finden die neu uebersetzte AMG-Library unter /home/metsch/CODES/AMGLIB. Wenn noch Fragen sind oder Euch Fehler auffallen, schreibt einfach an paradm(a)ins.uni-bonn.de. Viel Spass, Bram.

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[Himalaya-users] Upgrade himalaya
by Bram Metsch 25 Nov '10

25 Nov '10

Liebe himalaya-Nutzer, wir werden am nachsten Dienstag (30.11) anfangen, himalaya auf Ubuntu 10.04 zu upgraden, d.h. auf denselben Stand wie die Workstations zu bringen. himalaya wird voraussichtlich ab dem 6.12 wieder zur Verfuegung stehen. Eine wichtige Neuerung: Das Default-MPI wird in Zukunft openmpi sein. Alle Anwendungen muessen nach dem Upgrade neu kompiliert werden. Viele Gruesse, Bram. -- Dipl. Math. Bram Metsch Universitaet Bonn Institut fuer Numerische Simulation Wegelerstrasse 6 53115 Bonn Germany Phone: +49 228 733849 Fax: +49 228 737527 http://wissrech.ins.uni-bonn.de/index.php4?nav=people_staff_metsch

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[Himalaya-users] eifel-Knoten
by Bram Metsch 18 Oct '10

18 Oct '10

Liebe himalaya-Nutzer, wegen einer defekten Klimaanlage sind die Knoten des Eifel-Teilclusters (peak64q-1 bis peak64q-16 und peak64q-1 bis peak64q-3) zur Zeit abgeschaltet. Ein Reparaturtermin steht leider noch nicht fest. Der himalaya-Teilcluster (peak64-1 bis peak64-126) ist wie gewohnt verfuegbar. Viele Gruesse, Bram.

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[Himalaya-users] Binaries bitte nicht vorzeitig loeschen.
by Bram Metsch 12 Apr '10

12 Apr '10

Liebe himalaya-User, aus aktuellem Anlass folgenden Hinweis: Bitte ueberschreibt/loescht/verschiebt eure Executables NICHT, solange sie auf einem Knoten von himalaya oder eifel laufen. Jeder Prozess haelt immer sein Executable-File offen und benoetigt (Lese-)Zugriff auf dieses, ansonsten geht er in "uninterruptable sleep" und kann auch nicht gekillt werden. Ausserdem erhoehen die permanenten erfolglosen Leseversuche die Last auf everest. Wir muessen die betroffenen Knoten dann rebooten. Bitte erspart uns diese Arbeit und Euren Mitnutzern den unnoetigen Resourcenverbrauch. Viele Gruesse, Bram.

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[Himalaya-users] Wartungsarbeiten an der Klimaanlage am 11.02.2010
by Bram Metsch 08 Feb '10

08 Feb '10

Liebe himalaya-Nuzter, auf Grund von Wartungsarbeiten an der Klimaanlage muss himalaya am 11.02. nochmals ganztaegig abgeschaltet werden. Der Frontend und eifel stehen durchgehend zur Verfuegung. Viele Gruesse, Bram. -- Dipl. Math. Bram Metsch Universitaet Bonn Institut fuer Numerische Simulation Wegelerstrasse 6 53115 Bonn Germany Phone: +49 228 733849 Fax: +49 228 737527 http://wissrech.ins.uni-bonn.de/index.php4?nav=people_staff_metsch

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[Himalaya-users] Wartungsarbeiten an der Klimaanlage
by Bram Metsch 28 Jan '10

28 Jan '10

Liebe himalaya-Nuzter, auf Grund von Wartungsarbeiten an der Klimaanlage muss himalaya am 08.02. ganztaegig abgeschaltet werden. Der Frontend und eifel stehen durchgehend zur Verfuegung. Viele Gruesse, Bram. -- Dipl. Math. Bram Metsch Universitaet Bonn Institut fuer Numerische Simulation Wegelerstrasse 6 53115 Bonn Germany Phone: +49 228 733849 Fax: +49 228 737527 http://wissrech.ins.uni-bonn.de/index.php4?nav=people_staff_metsch

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[Himalaya-users] Wartungsarbeiten an himalaya am 9.11.2009
by Bram Metsch 03 Nov '09

03 Nov '09

Liebe himalaya-User, am 09.11. steht himalaya ab 09:00 wegen Wartungsarbeiten voraussichtlich bis 12:00 nicht zur Verfuegung. Mit freundlichen Gruessen, Bram Metsch. -- Dipl. Math. Bram Metsch Universitaet Bonn Institut fuer Numerische Simulation Wegelerstrasse 6 53115 Bonn Germany Phone: +49 228 733849 Fax: +49 228 737527 http://wissrech.ins.uni-bonn.de/index.php4?nav=people_staff_metsch

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[Himalaya-users] /data und /moldata-Platten
by Bram Metsch 18 Dec '08

18 Dec '08

Hallo, leider sind die Superblocks der /data- und der /moldata-Platten beim letzten Reboot beschaedigt worden. Von der /data-Platte konnte ein kleiner Teil des Dateisystems gerettet werden (siehe /data/lost+found). Die /moldata wurde jedoch komplett zerstoert. Wir bitten um Entschuldigung. Viele Gruesse, Bram. -- Dipl. Math. Bram Metsch Universitaet Bonn Institut fuer Numerische Simulation Wegelerstrasse 6 53115 Bonn Germany Phone: +49 228 733849 Fax: +49 228 737527 http://wissrech.ins.uni-bonn.de/index.php4?nav=people_staff_metsch

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[Himalaya-users] Festplattensysteme himalaya
by Bram Metsch 28 Nov '08

28 Nov '08

Liebe himalaya-Nutzer, die Struktur der Festplattensysteme auf himalaya ist bzw. wird wie folgt geandert: 1) Die /data-Platte ist in /visual umbenannt worden. Diese Platte soll ausschliesslich zur Visualisierung von Daten verwendet werden. Demnaecht wird diese Platte direkt mit newton und nicht mehr an helios geshared werden. Bitte entfernt alle Daten, die nicht zur Visualisierung vorgesehen sind, von der Platte 2) Fuer die Mitglieder der mol-Gruppe ist eine neue Platte namens /moldata hinzugefuegt worden, die auf allen Knoten gemounted ist (Quota 500GB per user). An alle mol-Mitglieder: Bitte transferiert alle Eure Daten von /scratch nach /mol 3) Die /scratch-Platte wird demnaechst in /data umbenannt werden. Viele Gruesse, Bram.

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