english version below ===================== Liebe Clusternutzer, der Cluster wurde aktualisiert und ist wieder einsatzbereit, jedoch muessen folgende Punkte beachtet werden. ------------------------------------------------------------ 1) Aufgrund einer neuen Benutzerverwaltung muss einmalig der Account verifiziert werden. Unter: http://guanaco/ipa/migration Benutzername und Passwort eingeben. Wenn der Prozess erfolgreich war, erscheint eine leere Seite. (Das Browserfenster kann geschlossen werden) ------------------------------------------------------------ 2) Via ssh auf den Cluster einlogen: ssh atacama Hier befinden sich home/<Benutzername> und /data/<Benutzername> ------------------------------------------------------------ 3) Als Betriebssystem laeuft Ubuntu 16.04 in der Grundinstallation mit Standardpaketquellen. Weitere Softwarewuensche bitte an: operator@ins.uni-bonn.de ------------------------------------------------------------ 4) Jobs werden mit SLURM statt TORQUE verwaltet. Erste Schritte: Quickguide: https://slurm.schedmd.com/quickstart.html Befehlsuebersicht pbs => slurm: https://confluence.csiro.au/display/SC/Reference+Guide%3A+Migrating+from+Tor... http://wissrech.ins.uni-bonn.de/inside/wikka/GridUsage Bei weiteren Fragen oder Problemen schreibt bitte eine eMail an: paradm@ins.uni-bonn.de Beispiel, Jobs abschicken: sbatch skript.txt Samplescript: #!/bin/bash #SBATCH --ntasks=256 #SBATCH -t 10:00 #SBATCH --mail-user=benutzername@ins.uni-bonn.de #SBATCH --job-name=testJobSlurm #SBATCH --workdir=/data/<Benutzername> mpirun $binary ------------------------------------------------------------ 5) Das Quota system wird in den naechsten Tage wieder mit den ueblichen Limits eingerichtet werden. ------------------------------------------------------------ 6) Die Daten von der alten /edata Partition finden sich nun unter /data/username/edata ------------------------------------------------------------ Viele Gruesse, Systemadministration =======================english version====================== Dear cluster user, the cluster has been rebuilt and is ready for production use. Following brief summary will get you up and running. ------------------------------------------------------------ 1) There is a new Identity Management Solution in place. For the first time access your account has to be verified by visiting: http://guanaco/ipa/migration and submitting your current username and password. If the process completed successfully you will be redirected to an empty page. (you can safely close your browser now) ------------------------------------------------------------ 2) Login to the cluster via ssh: ssh atacama There you will find your folders home/<username> and /data/<username> ------------------------------------------------------------ 3) A base installation of Ubuntu 16.04 with default repositories is running on the cluster. In need of additional software please contact: operator@ins.uni-bonn.de ------------------------------------------------------------ 4) Jobs are scheduled with SLURM instead of TORQUE. To help you get started: Quickguide: https://slurm.schedmd.com/quickstart.html Command reference pbs => slurm: https://confluence.csiro.au/display/SC/Reference+Guide%3A+Migrating+from+Tor... http://wissrech.ins.uni-bonn.de/inside/wikka/GridUsage For further discussion please write to: paradm@ins.uni-bonn.de Example, submit jobs: sbatch skript.txt Samplescript: #!/bin/bash #SBATCH --ntasks=256 #SBATCH -t 10:00 #SBATCH --mail-user=benutzername@ins.uni-bonn.de #SBATCH --job-name=testJobSlurm #SBATCH --workdir=/data/<Benutzername> mpirun $binary ------------------------------------------------------------ 5) The Quota system will be reinstalled in the next days with the usual limits. ------------------------------------------------------------ 6) The data from /edata were copied to /data/username/edata ------------------------------------------------------------ Best regards, System Administration _______________________________________________ Ins-wegelerstrasse mailing list Ins-wegelerstrasse@ins.uni-bonn.de https://mail.ins.uni-bonn.de/mailman/listinfo/ins-wegelerstrasse